29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4650 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4650  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0218  hypothetical protein  27.48 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.67 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0169  hypothetical protein  27.99 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0628  lateral flagellar export/assembly protein  22.78 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.49 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  23.49 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0708  flagellar motor switch protein  22.22 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0314955  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  23.84 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  37.68 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  28.24 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  28.24 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  28.24 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  32.14 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  29.01 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1695  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.67 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000545109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  32.35 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0060  flagellar switch protein FliM  41.67 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0400125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  26.15 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  32.35 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  28.36 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  29.23 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1648  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.33 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  27.69 
 
 		 348 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  22.14 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  29.41 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1458  flagellar motor switch protein FliM  35.11 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  26.42 
 
 		 354 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>