23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04969 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  100 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  80.15 
 
 		 272 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1458  flagellar motor switch protein FliM  21.53 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3982  hypothetical protein  26.8 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.99 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3662  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  28 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  37.84 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.84 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0081  hypothetical protein  23.22 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  30.6 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  30.6 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  32.2 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0628  lateral flagellar export/assembly protein  21.28 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0087  hypothetical protein  26.11 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  31.07 
 
 		 395 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  21.08 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  21.57 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4650  surface presentation of antigens (SPOA) protein  21.93 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0708  flagellar motor switch protein  21.8 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0314955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1648  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.09 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>