11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3662 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3662  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3982  hypothetical protein  51.88 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3479  hypothetical protein  48.81 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0087  hypothetical protein  43.34 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0081  hypothetical protein  46.13 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  24.75 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  25.91 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.59 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  25.59 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.08 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  26.49 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>