27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001182 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  80.15 
 
 		 272 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.74 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3982  hypothetical protein  25.52 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4650  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.07 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0081  hypothetical protein  25.65 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1458  flagellar motor switch protein FliM  21.85 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  31.62 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0087  hypothetical protein  26.11 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0628  lateral flagellar export/assembly protein  22.63 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  24.34 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  24.34 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3662  hypothetical protein  23.35 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.57 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  38.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  28.32 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0708  flagellar motor switch protein  23.13 
 
 		 299 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0314955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3479  hypothetical protein  26.04 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0169  hypothetical protein  32.65 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  18.97 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1648  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.25 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  20.1 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  18.53 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  19.12 
 
 		 322 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  19.12 
 
 		 322 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  19.12 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>