13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3385 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  98.94 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0628  lateral flagellar export/assembly protein  39.43 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0708  flagellar motor switch protein  38.81 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0314955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.48 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4650  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.99 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3982  hypothetical protein  24.3 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3479  hypothetical protein  23.25 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3662  hypothetical protein  25.35 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  38.57 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0081  hypothetical protein  23.78 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0087  hypothetical protein  22.87 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>