11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0081 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0081  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0087  hypothetical protein  65.96 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3982  hypothetical protein  49.83 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3479  hypothetical protein  49.65 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3662  hypothetical protein  46.13 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  25.65 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  23.22 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.78 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  23.78 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  34.43 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0628  lateral flagellar export/assembly protein  23.5 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>