11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3779 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  100 
 
 		 350 aa  725    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  42.73 
 
 		 666 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  42.49 
 
 		 552 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  43.53 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  42.11 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  39.14 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  39.93 
 
 		 700 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  32.58 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  33.75 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  26.28 
 
 		 547 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1353  secreted pectate lyase-family protein  23.89 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>