10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1434 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  100 
 
 
460 aa  935    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  32.58 
 
 
350 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  35.88 
 
 
416 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  31.56 
 
 
552 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  30.57 
 
 
666 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  31.16 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  33.43 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  31.87 
 
 
700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  31.16 
 
 
574 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  24.27 
 
 
547 aa  60.1  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>