11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1698 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1130    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1353  secreted pectate lyase-family protein  48.9 
 
 		 603 aa  495  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  24.9 
 
 		 552 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  26.6 
 
 		 350 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  25.72 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  24 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  22.84 
 
 		 354 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  24.49 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  24.27 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  25.24 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  23.92 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>