10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1159 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  100 
 
 		 354 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  43.53 
 
 		 350 aa  275  8e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  41.72 
 
 		 666 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  43.46 
 
 		 552 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  35.52 
 
 		 396 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  37.01 
 
 		 700 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  35.62 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  33.43 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  33.12 
 
 		 574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  22.84 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>