More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3071 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3071  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 109 aa  221  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  58.56 
 
 		 269 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  52.25 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  51.35 
 
 		 281 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  53 
 
 		 268 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  53 
 
 		 268 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  53 
 
 		 268 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  53 
 
 		 268 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  53 
 
 		 268 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  54.05 
 
 		 269 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  51 
 
 		 268 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  53 
 
 		 265 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  53 
 
 		 265 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  53 
 
 		 265 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  53 
 
 		 265 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  49.47 
 
 		 243 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0837  hypothetical protein  51.85 
 
 		 163 aa  95.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815342 
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  35.63 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  39.6 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  41.94 
 
 		 287 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  41.94 
 
 		 287 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  41.94 
 
 		 287 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  48 
 
 		 283 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  50 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  34.51 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  35.35 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  34.34 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  43.96 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  43.96 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  43.96 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  43.96 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1892  hypothetical protein  35.35 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  36.04 
 
 		 250 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  38.24 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1440  transposase  34.34 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.624391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2487  transposase  34.34 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  33 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  33.62 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  33.62 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  33.62 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  33.62 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  33.62 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  38.96 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  33.62 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3641  transposase  33.33 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  39.08 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4299  transposase  28.71 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5096  transposase  32 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  34.62 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2319  transposase  32 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  38 
 
 		 275 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>