More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0837 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0837  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  336  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815342 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  95.24 
 
 
268 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  84.52 
 
 
268 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  84.52 
 
 
268 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  84.52 
 
 
268 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  84.52 
 
 
268 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  84.52 
 
 
268 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  80.95 
 
 
281 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  77.65 
 
 
270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  60.26 
 
 
269 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  60 
 
 
269 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  73.33 
 
 
243 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  44.35 
 
 
265 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  44.35 
 
 
265 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  44.35 
 
 
265 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  44.35 
 
 
265 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3071  transposase IS4 family protein  51.85 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  48.44 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  48.44 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  48.44 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  38.04 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  38.04 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  38.04 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  48.44 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  48.44 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  48.44 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  48.44 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  48.44 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  37.5 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  38.64 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  38.64 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  38.64 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  38.64 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  38.64 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  38.64 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  38.27 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  32.58 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1195  transposase  37.97 
 
 
127 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.54444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  34.12 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1892  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  36.25 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  37.5 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1623  transposase  37.97 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  37.97 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  30.36 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4253  transposase  36.71 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>