35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2187 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 495 aa  974    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  46.53 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  45.71 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  43.06 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  43.57 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  40 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  42.03 
 
 		 525 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  41.78 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  41.55 
 
 		 607 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  40.85 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  40.88 
 
 		 641 aa  96.7  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  47.19 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  38.78 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  46.81 
 
 		 387 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  38.1 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  29.85 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  36 
 
 		 686 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  34.67 
 
 		 623 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 674 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  30.25 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  32.53 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  30.33 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  30.83 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  31.67 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  33.75 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  30.3 
 
 		 527 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  35.96 
 
 		 544 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  25.71 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4206  flagellar hook-length control protein  29.31 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1142  motD-related protein  32.5 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  31.87 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  39.68 
 
 		 568 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0112  hypothetical protein  30.43 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1330  flagellar hook-length control protein  32.43 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.165679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>