29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1495 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 532 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  56.29 
 
 		 526 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  54.33 
 
 		 525 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  68 
 
 		 534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  65.71 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  58.38 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  56.97 
 
 		 528 aa  187  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  42.14 
 
 		 495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  44.52 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  45.28 
 
 		 526 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  48.48 
 
 		 387 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  38.93 
 
 		 463 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  36.11 
 
 		 641 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  38.31 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  36.24 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  30.72 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  30.88 
 
 		 674 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  29.58 
 
 		 778 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  27.55 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  34.78 
 
 		 531 aa  47  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0847  flagellar hook-length control protein  34.48 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  30.6 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4196  flagellar hook-length control protein  34.33 
 
 		 416 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2977  hypothetical protein  28.09 
 
 		 528 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618788  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  34.33 
 
 		 420 aa  44.3  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  31.25 
 
 		 527 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  28.05 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  30.6 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  31.63 
 
 		 586 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>