38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1880 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  100 
 
 		 542 aa  1043    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  70.5 
 
 		 525 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  61.24 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  64.14 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  60.36 
 
 		 532 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  60.77 
 
 		 525 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  46.58 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  44.14 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  40.82 
 
 		 641 aa  100  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  51 
 
 		 387 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  48.31 
 
 		 526 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  37.01 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  45.28 
 
 		 463 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 607 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  39.51 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  37.25 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  30.23 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  29.1 
 
 		 580 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  30.39 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  34.83 
 
 		 491 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  29.73 
 
 		 516 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  31.73 
 
 		 631 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  40.28 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  35.09 
 
 		 686 aa  47.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  29.2 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1330  flagellar hook-length control protein  36.99 
 
 		 500 aa  47  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.165679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  26.45 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  25.56 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  31.94 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  35.09 
 
 		 623 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  28.77 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  35.56 
 
 		 544 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  38.1 
 
 		 508 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0776  flagellar hook-length control protein  35.38 
 
 		 536 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.460138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  36.07 
 
 		 718 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  36.07 
 
 		 702 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3221  hypothetical protein  32.47 
 
 		 670 aa  43.5  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  34.43 
 
 		 579 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>