28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3963 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 526 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  69.84 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  73.56 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  71.05 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  64.24 
 
 		 525 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  62.58 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  68.09 
 
 		 542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  45.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  42.86 
 
 		 526 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  46.21 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  52.13 
 
 		 387 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  47.25 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  47.25 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  34.72 
 
 		 641 aa  87  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  41.3 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  30.07 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  34.57 
 
 		 778 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  30.33 
 
 		 674 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  40.74 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  35.29 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  31.31 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2434  flagellar hook-length control protein  36.59 
 
 		 693 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  40.74 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4196  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 		 531 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0847  flagellar hook-length control protein  32.93 
 
 		 504 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  35.29 
 
 		 592 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>