20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3364 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 778 aa  1528    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2977  hypothetical protein  32.17 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618788  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1335  hypothetical protein  32.5 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0004  hypothetical protein  32.5 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2596  hypothetical protein  36.92 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.440368  hitchhiker  0.00000208928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4206  flagellar hook-length control protein  32.5 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  31.97 
 
 		 526 aa  54.3  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  28.46 
 
 		 534 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1622  hypothetical protein  29.73 
 
 		 397 aa  51.6  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 		 532 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  35.11 
 
 		 387 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  29.69 
 
 		 526 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  35.14 
 
 		 525 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  32.65 
 
 		 446 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  34.85 
 
 		 525 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 		 528 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  33.87 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 		 463 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  41.07 
 
 		 463 aa  45.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>