15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4206 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4206  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 612 aa  1196    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2977  hypothetical protein  35.83 
 
 		 528 aa  67  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618788  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  32.5 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2596  hypothetical protein  28.95 
 
 		 338 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.440368  hitchhiker  0.00000208928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1335  hypothetical protein  33.93 
 
 		 739 aa  50.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0004  hypothetical protein  33.93 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 		 580 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  37.35 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1622  hypothetical protein  32.22 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  28.99 
 
 		 495 aa  48.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  33.73 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 		 526 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  25.41 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  33.61 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  32.61 
 
 		 495 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>