45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0575 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 552 aa  1061    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  38.04 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  31.58 
 
 		 570 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  31.58 
 
 		 686 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  30.26 
 
 		 623 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2045  flagellar hook-length control protein  37.31 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  37.93 
 
 		 768 aa  53.5  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1397  flagellar hook-length control protein  26.87 
 
 		 637 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.761037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  34.12 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  34.57 
 
 		 674 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  28 
 
 		 660 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  28.72 
 
 		 723 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  28 
 
 		 656 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  36.59 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  37.18 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  40.51 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  36.08 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2039  flagellar hook-length control protein  31.65 
 
 		 383 aa  48.9  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  32.97 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  40.51 
 
 		 478 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2711  flagellar hook-length control protein  27.52 
 
 		 465 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 		 568 aa  47.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  26.51 
 
 		 604 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0257  flagellar hook-length control protein  32 
 
 		 674 aa  47.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0259  flagellar hook-length control protein  32 
 
 		 658 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  37.68 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  39.06 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0471  flagellar hook-length control protein  32 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1760  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  39.68 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 579 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  29.89 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  29.76 
 
 		 660 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  32.14 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  34.06 
 
 		 364 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  31.94 
 
 		 542 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  33.98 
 
 		 351 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  36.76 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  30.67 
 
 		 534 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 393 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4206  flagellar hook-length control protein  28.89 
 
 		 612 aa  43.5  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>