30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1760 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1760  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
517 aa  1000    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  38.3 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2039  flagellar hook-length control protein  29.35 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  26 
 
 
674 aa  57.4  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4173  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
452 aa  57.4  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.11 
 
 
491 aa  57  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2403  flagellar hook-length control protein  29.69 
 
 
580 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  32.46 
 
 
593 aa  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  42.19 
 
 
456 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  34.15 
 
 
686 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0693  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
527 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640242  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  29.29 
 
 
516 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  32.93 
 
 
407 aa  47.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  30.49 
 
 
478 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 
552 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 
579 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  32.77 
 
 
723 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  34.15 
 
 
623 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 
585 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 
586 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  28.12 
 
 
527 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  36.49 
 
 
367 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.949278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  27.93 
 
 
544 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 
567 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  36.51 
 
 
523 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 
480 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  29.35 
 
 
568 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  30.11 
 
 
525 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  30.11 
 
 
525 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>