48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2403 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2403  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 580 aa  1160    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0693  flagellar hook-length control protein  43 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1760  flagellar hook-length control protein  30.15 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2711  flagellar hook-length control protein  35 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1397  flagellar hook-length control protein  28.87 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.761037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  30.12 
 
 		 768 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2039  flagellar hook-length control protein  34.31 
 
 		 383 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  34.51 
 
 		 364 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  29.38 
 
 		 723 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  29.13 
 
 		 674 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  27.59 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  37.18 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  29.41 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  26.19 
 
 		 623 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1117  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 		 407 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  26.28 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  30.77 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  33.01 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  30.1 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  33.73 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  37.65 
 
 		 456 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  36.84 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4173  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 452 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  38.03 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4126  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 		 541 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  29.01 
 
 		 414 aa  47.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  28.66 
 
 		 420 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  34.25 
 
 		 360 aa  47.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 407 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  34.18 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2009  flagellar hook-length control protein  36.76 
 
 		 396 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  23.94 
 
 		 580 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  37 
 
 		 552 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0776  flagellar hook-length control protein  28.05 
 
 		 536 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.460138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  29.52 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 		 512 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  29.52 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  34.18 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  32.79 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  27.14 
 
 		 508 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  34.29 
 
 		 487 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3042  flagellar hook-length control protein  29.49 
 
 		 723 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  25.32 
 
 		 450 aa  43.9  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  27.85 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2045  flagellar hook-length control protein  25.42 
 
 		 510 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  27.85 
 
 		 407 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  21.34 
 
 		 592 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  27.85 
 
 		 405 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.543478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>