43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0855 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  100 
 
 
723 aa  1444    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2045  flagellar hook-length control protein  38.02 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0471  flagellar hook-length control protein  48.86 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2711  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16830  flagellar hook-length control protein  37.04 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1117  flagellar hook-length control protein  44.44 
 
 
407 aa  60.8  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1687  flagellar hook-length control protein  32.76 
 
 
457 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2009  flagellar hook-length control protein  37.04 
 
 
396 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 
531 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1501  flagellar hook-length control protein  28.33 
 
 
533 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  25.45 
 
 
580 aa  54.3  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  31.46 
 
 
619 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  28.92 
 
 
552 aa  51.2  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  31.08 
 
 
686 aa  50.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  28.03 
 
 
656 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  29.73 
 
 
623 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2403  flagellar hook-length control protein  32.56 
 
 
580 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2167  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 
512 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0776  flagellar hook-length control protein  29.11 
 
 
536 aa  48.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.460138  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1646  flagellar hook-length control protein  29.09 
 
 
589 aa  47.4  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.925777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  26.51 
 
 
674 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4126  flagellar hook-length control protein  31.43 
 
 
541 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 
660 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  25 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  31.91 
 
 
604 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  30.34 
 
 
592 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  25 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  27.52 
 
 
460 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  29.9 
 
 
443 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1760  flagellar hook-length control protein  32.77 
 
 
517 aa  45.8  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  29.29 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 
435 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1330  flagellar hook-length control protein  25.61 
 
 
500 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.165679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 
461 aa  44.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 
452 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 
421 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1397  flagellar hook-length control protein  26.74 
 
 
637 aa  44.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.761037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 
421 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  28.28 
 
 
428 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  29.67 
 
 
570 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 
421 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 
450 aa  43.9  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  23.91 
 
 
516 aa  43.9  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>