47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3572 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 367 aa  730    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1437  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  35.51 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  27.87 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  32.99 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  32.39 
 
 		 656 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  28.42 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  27.87 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  32.58 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  28.48 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 604 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  30 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  32.29 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  30.56 
 
 		 516 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  34.43 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  30.28 
 
 		 525 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  30.28 
 
 		 525 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  34.43 
 
 		 474 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 503 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  27.63 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  34.38 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  30.99 
 
 		 660 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1760  flagellar hook-length control protein  36.49 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  31.25 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2770  flagellar hook-length control protein FliK  29.55 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.131084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0693  flagellar hook-length control protein  26.62 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  30 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  34.04 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  34.38 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  29.35 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  38.89 
 
 		 641 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  27.22 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  30.21 
 
 		 674 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  34.62 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 458 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  32.05 
 
 		 602 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  29.57 
 
 		 631 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  27.03 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  27.78 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  27.78 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  30.85 
 
 		 407 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  26.04 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16830  flagellar hook-length control protein  23.13 
 
 		 500 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>