103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2952 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
407 aa  792    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  39.84 
 
 
431 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  40.08 
 
 
450 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  38.4 
 
 
452 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  61.18 
 
 
430 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  56.08 
 
 
523 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  37.13 
 
 
443 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  48.31 
 
 
375 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  38.94 
 
 
375 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000764801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  48.31 
 
 
375 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0151155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  48.31 
 
 
375 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  42.05 
 
 
405 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  56.43 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  42.21 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  38.02 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  41.54 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  37.96 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  41.54 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  46.79 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  51.11 
 
 
456 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  46.36 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4173  flagellar hook-length control protein  44.44 
 
 
452 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  42.73 
 
 
487 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5266  flagellar hook-length control protein  50.55 
 
 
495 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.265097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5102  flagellar hook-length control protein  51.65 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290575  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  40.31 
 
 
480 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  39.34 
 
 
447 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  46.51 
 
 
465 aa  87  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  47.67 
 
 
455 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  47.67 
 
 
466 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  47.67 
 
 
466 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  45.56 
 
 
497 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  47.67 
 
 
458 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  41.59 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  47.67 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  44.12 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  47.67 
 
 
677 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  42.22 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  44.83 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  44.83 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  45.35 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  40.96 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  40 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1973  flagellar hook-length control protein  41.12 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  27.53 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 
525 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 
525 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  32.65 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1437  flagellar hook-length control protein  36.67 
 
 
650 aa  66.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  29.51 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  29.66 
 
 
567 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  37.07 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  27.97 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  27.97 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  33.71 
 
 
408 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  33.33 
 
 
324 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  34.34 
 
 
487 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
516 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  30.6 
 
 
585 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  29.5 
 
 
544 aa  59.7  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  37.11 
 
 
527 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  31.78 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  33.67 
 
 
593 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  32.12 
 
 
579 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 
674 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  29.93 
 
 
768 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  28.93 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  28.93 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0570  flagellar hook-length control protein  32.71 
 
 
499 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  38.27 
 
 
537 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  38.27 
 
 
717 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  38.75 
 
 
718 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  35.96 
 
 
490 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  31.4 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  31.4 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  38.27 
 
 
702 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  39.24 
 
 
568 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0972  flagellar hook-length control protein  34.23 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  30 
 
 
609 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  30.67 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  30.67 
 
 
467 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3042  flagellar hook-length control protein  31.71 
 
 
723 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  31.03 
 
 
485 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  31.82 
 
 
580 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  28.03 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  32.86 
 
 
686 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2403  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 
580 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  29.03 
 
 
623 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
369 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  27.18 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4126  flagellar hook-length control protein  31.17 
 
 
541 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  27.01 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  27.01 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  32 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  35.42 
 
 
552 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  30.85 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.949278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>