112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1329 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 495 aa  989    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  36.87 
 
 		 512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  59.77 
 
 		 527 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  59.77 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  61.25 
 
 		 585 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  60.62 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.44 
 
 		 491 aa  203  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  50.75 
 
 		 568 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  54.02 
 
 		 544 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  45.45 
 
 		 718 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  47.72 
 
 		 717 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  62.73 
 
 		 609 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  47.7 
 
 		 702 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  52.69 
 
 		 537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  47.98 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  38.41 
 
 		 686 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  41.96 
 
 		 768 aa  85.1  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  35.04 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  50.75 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  35.25 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  28.47 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  31.88 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  30.99 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  44.44 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  25.28 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  36.14 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  32.74 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  39.51 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5102  flagellar hook-length control protein  37.66 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5266  flagellar hook-length control protein  37.8 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.265097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  40 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  38.96 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  38.96 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  30.07 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  27.82 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3042  flagellar hook-length control protein  38.14 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  41.79 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  39.51 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  39.51 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  27.13 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  35.37 
 
 		 516 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  41.98 
 
 		 407 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 455 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  36.25 
 
 		 449 aa  57  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  34.48 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  34.29 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  41.98 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  41.98 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  41.98 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  32.05 
 
 		 360 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  34.04 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0555  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  34.48 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  34.48 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  34.48 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  29.9 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  36.14 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  34.48 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  41.98 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  34.57 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  35.71 
 
 		 677 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  34.57 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  31.58 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  31.58 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  32.71 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  23.44 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  34.02 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 		 438 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  31.11 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  31.11 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000764801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  31.11 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0151155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  31.11 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  31.87 
 
 		 523 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  34.38 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  31.9 
 
 		 383 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  35.06 
 
 		 407 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  31.11 
 
 		 375 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  31.11 
 
 		 375 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  31.58 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  28.68 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  30.53 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4173  flagellar hook-length control protein  35.11 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  31.58 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  35 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  27.66 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  32.89 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  32.89 
 
 		 435 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  30.97 
 
 		 656 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>