21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4463 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  88.75 
 
 		 463 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 463 aa  864    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  57.96 
 
 		 526 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  58.28 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  69.23 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  44.09 
 
 		 525 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  45.71 
 
 		 528 aa  94  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  45.28 
 
 		 542 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  40.29 
 
 		 525 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  42.86 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  38.31 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  43.59 
 
 		 532 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  44.44 
 
 		 526 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  33.91 
 
 		 607 aa  73.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  48.44 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  34.88 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1335  hypothetical protein  33.71 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  41.07 
 
 		 778 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0004  hypothetical protein  33.71 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  35.77 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1677  hypothetical protein  38.33 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107938  normal  0.0571182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>