29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0548 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 607 aa  1142    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  42.25 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  34.64 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  40.6 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  37.93 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  38.17 
 
 		 528 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  40.74 
 
 		 525 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  34.86 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  37.16 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  38.36 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  34.9 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  39 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  36.27 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  29.37 
 
 		 558 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2045  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 		 510 aa  54.3  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  29.51 
 
 		 619 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2977  hypothetical protein  30.47 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618788  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0004  hypothetical protein  42.25 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3221  hypothetical protein  40 
 
 		 670 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  31.06 
 
 		 656 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1335  hypothetical protein  42.25 
 
 		 739 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  31.71 
 
 		 592 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1109  putative chemotaxis MotD protein  33.33 
 
 		 356 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307253  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0112  hypothetical protein  29.41 
 
 		 427 aa  43.9  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  29.11 
 
 		 552 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 		 531 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>