22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0602 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 528 aa  1029    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  69.31 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  67.12 
 
 		 534 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  62.58 
 
 		 526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4117  flagellar hook-length control protein  61.54 
 
 		 525 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  64.29 
 
 		 542 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1495  flagellar hook-length control protein  56.36 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  43.57 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  48.97 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6064  flagellar hook-length control protein  53.47 
 
 		 387 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  48.31 
 
 		 526 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4463  flagellar hook-length control protein  45.71 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  45.71 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  36.69 
 
 		 641 aa  88.6  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  38.17 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1008  flagellar hook-length control protein  37.04 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345301  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  29.12 
 
 		 580 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3364  putative flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 		 778 aa  47  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  36.99 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  36.99 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  31.4 
 
 		 674 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  31.63 
 
 		 491 aa  43.5  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>