19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1109 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1109  putative chemotaxis MotD protein  100 
 
 		 356 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307253  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3221  hypothetical protein  42.06 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0612  flagellar hook-length control protein  35.46 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.372592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0633  hypothetical protein  41.75 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0826674  normal  0.59039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0644  hypothetical protein  32.69 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2685  hypothetical protein  24.66 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0039  hypothetical protein  26.13 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1677  hypothetical protein  37.93 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107938  normal  0.0571182 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1142  motD-related protein  41.54 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0367  chemotaxis motility protein  33.77 
 
 		 477 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  40 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0335  chemotaxis motility protein  35.38 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4196  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1125  putative flagellar motor protein  31.76 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0273  chemotaxis protein (motility protein D)  28.57 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309782  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0847  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0282  flagellar hook-length control protein  28.41 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0112  hypothetical protein  32.98 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>