17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0282 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0282  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
392 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0273  chemotaxis protein (motility protein D)  31.55 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309782  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0367  chemotaxis motility protein  45.71 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0335  chemotaxis motility protein  45.71 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0760  chemotaxis motility protein  32.56 
 
 
619 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.733725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0612  flagellar hook-length control protein  32.56 
 
 
618 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.372592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0644  hypothetical protein  32.82 
 
 
605 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0633  hypothetical protein  34 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0826674  normal  0.59039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0039  hypothetical protein  35.45 
 
 
575 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1142  motD-related protein  38.57 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3221  hypothetical protein  35.53 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2685  hypothetical protein  30.85 
 
 
569 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  37.14 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4196  flagellar hook-length control protein  37.31 
 
 
416 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1109  putative chemotaxis MotD protein  28.41 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307253  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1656  flagellar hook-length control protein  30.19 
 
 
663 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.410936  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1125  putative flagellar motor protein  25 
 
 
431 aa  42.7  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>