16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0273 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0273  chemotaxis protein (motility protein D)  100 
 
 		 471 aa  930    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309782  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0335  chemotaxis motility protein  40.98 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0367  chemotaxis motility protein  42 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0760  chemotaxis motility protein  42.62 
 
 		 619 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.733725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0282  flagellar hook-length control protein  32.52 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3221  hypothetical protein  36.62 
 
 		 670 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0633  hypothetical protein  32.45 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0826674  normal  0.59039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0612  flagellar hook-length control protein  30.17 
 
 		 618 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.372592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0644  hypothetical protein  34.65 
 
 		 605 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2685  hypothetical protein  32.35 
 
 		 569 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1677  hypothetical protein  30.08 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107938  normal  0.0571182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0039  hypothetical protein  25.81 
 
 		 575 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1142  motD-related protein  37.29 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1109  putative chemotaxis MotD protein  25.64 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307253  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4196  flagellar hook-length control protein  38.71 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1047  motD-related protein  35.59 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>