22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0248 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 631 aa  1258    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 		 619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  29.21 
 
 		 592 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  44.75 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2434  flagellar hook-length control protein  40.88 
 
 		 693 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3221  hypothetical protein  31.82 
 
 		 670 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0847  flagellar hook-length control protein  28.32 
 
 		 504 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  37.66 
 
 		 525 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  37.66 
 
 		 525 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 		 641 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  32.08 
 
 		 542 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0548  flagellar hook-length control protein  35.05 
 
 		 607 aa  48.9  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  30 
 
 		 604 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  26.83 
 
 		 367 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  30.09 
 
 		 580 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0986  flagellar hook-length control protein  31.73 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  33.8 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1330  flagellar hook-length control protein  38.1 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.165679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16830  flagellar hook-length control protein  29.9 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2711  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 465 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  26.44 
 
 		 660 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  31.87 
 
 		 495 aa  44.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>