24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0455 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0455  HhH-GPD family protein  100 
 
 
254 aa  520  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1665  HhH-GPD family protein  74.48 
 
 
247 aa  383  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1611  HhH-GPD family protein  72.2 
 
 
248 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1823  HhH-GPD family protein  67.77 
 
 
252 aa  352  4e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1583  hypothetical protein  40.38 
 
 
295 aa  154  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  28.86 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.03 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.72 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  30.77 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.88 
 
 
238 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.85 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  28.68 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  26.7 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.88 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.23 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  38.46 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  29.35 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  40.91 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.73 
 
 
300 aa  42.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.47 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  27.49 
 
 
220 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  26.04 
 
 
216 aa  42  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  31.45 
 
 
232 aa  42  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>