21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1611 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1611  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0455  HhH-GPD family protein  72.2 
 
 		 254 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1665  HhH-GPD family protein  68.44 
 
 		 247 aa  358  6e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1823  HhH-GPD family protein  66.53 
 
 		 252 aa  355  5e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1583  hypothetical protein  42.97 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.71 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.31 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.6 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  30.69 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  31.63 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  30.77 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  27.98 
 
 		 233 aa  45.4  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.44 
 
 		 274 aa  45.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  29.7 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  26.4 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.21 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  25.51 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.94 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  31.2 
 
 		 230 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>