13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1583 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1611  HhH-GPD family protein  42.97 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1665  HhH-GPD family protein  41.92 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1823  HhH-GPD family protein  42.37 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0455  HhH-GPD family protein  40.38 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  25.22 
 
 		 227 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  30.13 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  32.84 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.57 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  32.52 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  31.52 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.4 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  30.63 
 
 		 219 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>