24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2463 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  43.04 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3372  hypothetical protein  42.05 
 
 
100 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  31.53 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  28.72 
 
 
101 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  27.27 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  31.4 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4140  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  29.46 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  46.34 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2859  hypothetical protein  28.7 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339127  normal  0.413255 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  42.62 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  38.36 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  30.23 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4236  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  33.9 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  33.9 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  29.58 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  44.07 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>