17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0152 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  204  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  44.95 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1010  hypothetical protein  49.41 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  43.86 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  31.53 
 
 
134 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  35.9 
 
 
104 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  34.21 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  34.21 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  28.89 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  36.76 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  44.44 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  32.05 
 
 
83 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  36 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>