19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2896 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  176  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  52.31 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  38.57 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  43.42 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  43.42 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  45.95 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  48.78 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  40.96 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  34.21 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  48.61 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  38.3 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01350  hypothetical protein  41.07 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.681566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  31.18 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2971  hypothetical protein  44.74 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2671  hypothetical protein  55.17 
 
 		 114 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654749  normal  0.0560512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>