13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2987 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  350  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03500  hypothetical protein  42.93 
 
 
196 aa  111  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.16514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01350  hypothetical protein  41.18 
 
 
193 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.681566  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  26.47 
 
 
124 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0066  hypothetical protein  27.42 
 
 
153 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  40.96 
 
 
90 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  39.76 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  29.46 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  29.33 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  34.23 
 
 
101 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  28.05 
 
 
100 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2859  hypothetical protein  27.21 
 
 
118 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339127  normal  0.413255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0401  17 kDa surface antigen  25.31 
 
 
385 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>