19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0066 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  28.66 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  33.75 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  32.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3372  hypothetical protein  25.71 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  31.65 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  33.75 
 
 		 108 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03500  hypothetical protein  30.19 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.16514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  42.22 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0479  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  48.72 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  46.81 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  46.81 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  41.3 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0156  hypothetical protein  45.65 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  29.13 
 
 		 104 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>