20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2264 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  204  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  35.8 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  39.47 
 
 
103 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  31.4 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  28.72 
 
 
134 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  35.38 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  29.76 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  35.44 
 
 
204 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  28.89 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  34.23 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  34.67 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0076  hypothetical protein  40.68 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0133751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  26.37 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  26.37 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  34.83 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  36.76 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1262  hypothetical protein  36.71 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  30 
 
 
115 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>