15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4925 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  58.16 
 
 
100 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  38.54 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  43.86 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  43.86 
 
 
108 aa  52  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  28.3 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0421  hypothetical protein  27 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0380  hypothetical protein  34.21 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  27.47 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  26.44 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  30.77 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  28.74 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  24.42 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  26.14 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  36.76 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>