22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03405 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  240  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  43.33 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1010  hypothetical protein  42.59 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  43.86 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  29.81 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0156  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  32.05 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  42.31 
 
 
96 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  34.86 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  32.26 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  36.96 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  33.94 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0479  hypothetical protein  37.35 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  46.15 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  33.77 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  33.77 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1155  hypothetical protein  33.01 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0011956  hitchhiker  0.0048484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4740  hypothetical protein  34.02 
 
 
119 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  35.96 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0166  hypothetical protein  58.33 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.742755  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  44.23 
 
 
115 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  31.13 
 
 
104 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>