14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0438 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  264  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0432  hypothetical protein  99.28 
 
 
138 aa  261  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  36.59 
 
 
87 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  46.94 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  36.96 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  34.38 
 
 
110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  34.38 
 
 
110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  33.67 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  40.38 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  30.59 
 
 
178 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0156  hypothetical protein  26.05 
 
 
117 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>