12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0432 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0432  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  262  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  99.28 
 
 
138 aa  261  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  46.03 
 
 
204 aa  54.7  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  48.98 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  35.37 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  34.38 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  34.38 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  36.96 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  42.5 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  42.5 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  33.03 
 
 
115 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>