12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0749 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  166  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  38.82 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  43.04 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0748  hypothetical protein  34.12 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2859  hypothetical protein  36.14 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339127  normal  0.413255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  32.05 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1155  hypothetical protein  32.89 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0011956  hitchhiker  0.0048484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  30 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3372  hypothetical protein  29.55 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  32.05 
 
 		 108 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>