17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6329 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  199  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  58.16 
 
 
100 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  34.12 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  29.81 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  32.18 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  40.68 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0421  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  43.33 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  26.51 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  31.87 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  29.21 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  29.07 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0749  hypothetical protein  31.25 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  28.05 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0380  hypothetical protein  30.38 
 
 
109 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  29.58 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>