14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2173 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  233  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  71.3 
 
 
115 aa  174  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  59.13 
 
 
107 aa  140  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  60.18 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  60.75 
 
 
108 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  55.34 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2121  hypothetical protein  60.71 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  28.3 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2446  hypothetical protein  27.45 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.644391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  31.87 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  53.66 
 
 
115 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0421  hypothetical protein  30.49 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  44.23 
 
 
124 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>