13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2121 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2121  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  224  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  80.37 
 
 
108 aa  186  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  80.19 
 
 
107 aa  178  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  75 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  72.64 
 
 
108 aa  161  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  60.71 
 
 
115 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  61.47 
 
 
115 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0421  hypothetical protein  31.03 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  27.71 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  24.44 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  30.61 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  27.84 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0007  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>