22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2780 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  88.12 
 
 		 284 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  71.15 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  68.82 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  66.67 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  60.78 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0392  hypothetical protein  63.92 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  53.85 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  52.31 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  35.8 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  51.92 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  45.28 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1336  hypothetical protein  38.27 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  42.19 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  42 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  35.9 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  27.93 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  38.36 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  28.28 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  26.47 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  31.13 
 
 		 124 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>